En los laboratorios de la Planta Piloto de Química Fina se llevan a cabo los proyectos de síntesis orgánica que incluyen la obtención de compuestos a diversas escalas (desde mg hasta Kg), integrando en las rutas sintéticas procedimientos y tecnologias "verdes". Se detallan las actividades más representativas realizadas en los últimos 18 años. 

• Síntesis y desarrollo de nuevos fármacos.
• Métodos mejorados para la síntesis de fármacos genéricos.
• Síntesis de lotes piloto de fármacos en desarrollo, para uso preclínico.
• Síntesis multigramo de reactivos organicos.
• Síntesis de productos e intermedios orgánicos no comerciales.
• Determinación de impurezas en fármacos y síntesis de las mismas. 
• Síntesis de materiales poliméricos. 
• Sintesis de compuestos organometalicos.
• Síntesis total de productos naturales bioactivos.
• Preparación de Drug Master File.